Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Nek9Q8K1R7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Nek9Q8K1R7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek9Q8K1R7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms