Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sde2Q8K1J5 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sde2Q8K1J5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms