Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Cldn34c1Q8K193 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Cldn34c1Q8K193 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Cldn34c1Q8K193 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Cldn34c1Q8K193 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Cldn34c1Q8K193 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Cldn34c1Q8K193 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Cldn34c1Q8K193 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Cldn34c1Q8K193 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn34c1Q8K193 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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