Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf628Q8CJ78 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf628Q8CJ78 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf628Q8CJ78 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf628Q8CJ78 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf628Q8CJ78 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf628Q8CJ78 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf628Q8CJ78 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf628Q8CJ78 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf628Q8CJ78 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf628Q8CJ78 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf628Q8CJ78 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf628Q8CJ78 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf628Q8CJ78 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf628Q8CJ78 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf628Q8CJ78 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf628Q8CJ78 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Znf628Q8CJ78 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf628Q8CJ78 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf628Q8CJ78 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf628Q8CJ78 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf628Q8CJ78 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf628Q8CJ78 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf628Q8CJ78 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf628Q8CJ78 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf628Q8CJ78 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf628Q8CJ78 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf628Q8CJ78 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf628Q8CJ78 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf628Q8CJ78 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Znf628Q8CJ78 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Znf628Q8CJ78 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Znf628Q8CJ78 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Znf628Q8CJ78 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Znf628Q8CJ78 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Znf628Q8CJ78 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Znf628Q8CJ78 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Znf628Q8CJ78 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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