Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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SbsnQ8CIT9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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SbsnQ8CIT9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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SbsnQ8CIT9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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SbsnQ8CIT9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SbsnQ8CIT9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms