Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Csnka2ipQ8CH19 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Csnka2ipQ8CH19 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Csnka2ipQ8CH19 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Csnka2ipQ8CH19 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Csnka2ipQ8CH19 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Csnka2ipQ8CH19 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Csnka2ipQ8CH19 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Csnka2ipQ8CH19 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Csnka2ipQ8CH19 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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