Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ercc8Q8CFD5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ercc8Q8CFD5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ercc8Q8CFD5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ercc8Q8CFD5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ercc8Q8CFD5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ercc8Q8CFD5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ercc8Q8CFD5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ercc8Q8CFD5 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ercc8Q8CFD5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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