Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Usp27Q8CEG8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Usp27Q8CEG8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Usp27Q8CEG8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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Usp27Q8CEG8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Usp27Q8CEG8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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Usp27Q8CEG8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp27Q8CEG8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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