Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh13Q8CEE7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms