Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Atg4aQ8C9S8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Atg4aQ8C9S8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Atg4aQ8C9S8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Atg4aQ8C9S8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg4aQ8C9S8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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