Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Usp20Q8C6M1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Usp20Q8C6M1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Usp20Q8C6M1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Usp20Q8C6M1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Usp20Q8C6M1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Usp20Q8C6M1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Usp20Q8C6M1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Usp20Q8C6M1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Usp20Q8C6M1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Usp20Q8C6M1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Usp20Q8C6M1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Usp20Q8C6M1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Usp20Q8C6M1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Usp20Q8C6M1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp20Q8C6M1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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