Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa22Q8C1N8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms