Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Atg16l1Q8C0J2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Atg16l1Q8C0J2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Atg16l1Q8C0J2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Atg16l1Q8C0J2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Atg16l1Q8C0J2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Atg16l1Q8C0J2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Atg16l1Q8C0J2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Atg16l1Q8C0J2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Atg16l1Q8C0J2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg16l1Q8C0J2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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