Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm43674-201ENSMUST00000196313 791 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 CT010462.1-201ENSMUST00000220554 1200 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 AC144733.1-201ENSMUST00000222893 1289 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Trim35Q8C006 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Trim35Q8C006 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 Dtwd1-201ENSMUST00000110437 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim35Q8C006 1700013D24Rik-201ENSMUST00000112537 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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