Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Usp38Q8BW70 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Usp38Q8BW70 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Usp38Q8BW70 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Usp38Q8BW70 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Usp38Q8BW70 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Usp38Q8BW70 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Usp38Q8BW70 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Usp38Q8BW70 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp38Q8BW70 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp38Q8BW70 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp38Q8BW70 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp38Q8BW70 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp38Q8BW70 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Usp38Q8BW70 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Usp38Q8BW70 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Usp38Q8BW70 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Usp38Q8BW70 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Usp38Q8BW70 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Usp38Q8BW70 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp38Q8BW70 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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