Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmod1Q8BVA4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmod1Q8BVA4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms