Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms