Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pum3Q8BKS9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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