Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnrc6bQ8BKI2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms