Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHB9

Clic6, Chloride intracellular channel protein 6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic6Q8BHB9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Clic6Q8BHB9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Clic6Q8BHB9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Clic6Q8BHB9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Clic6Q8BHB9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clic6Q8BHB9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clic6Q8BHB9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clic6Q8BHB9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clic6Q8BHB9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms