Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Atg4bQ8BGE6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Atg4bQ8BGE6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Atg4bQ8BGE6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Atg4bQ8BGE6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Atg4bQ8BGE6 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Atg4bQ8BGE6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Atg4bQ8BGE6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg4bQ8BGE6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms