Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc172Q810N9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc172Q810N9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms