Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Amigo1Q80ZD8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms