Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed4Q80WQ9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms