Protein–RNA interactions for Protein: Q80U30

Clec16a, Protein CLEC16A, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec16aQ80U30 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Clec16aQ80U30 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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Clec16aQ80U30 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Clec16aQ80U30 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Clec16aQ80U30 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clec16aQ80U30 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms