Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NischQ80TM9 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NischQ80TM9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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