Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctdp1Q7TSG2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdp1Q7TSG2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms