Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU6

Znf250, Zinc finger protein 250, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf250Q7TNU6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Znf250Q7TNU6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Znf250Q7TNU6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms