Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp3Q7TNH6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nphp3Q7TNH6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nphp3Q7TNH6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nphp3Q7TNH6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms