Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim12Q78RX3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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