Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ubfd1Q78JW9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubfd1Q78JW9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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