Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed3Q78IS1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms