Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rph3alQ768S4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms