Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cnih3Q6ZWS4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms