Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Topbp1Q6ZQF0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Topbp1Q6ZQF0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms