Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS2

Ssxb5, MCG68109, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb5Q6XAS2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ssxb5Q6XAS2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ssxb5Q6XAS2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ssxb5Q6XAS2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb5Q6XAS2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms