Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tmeff1Q6PFE7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tmeff1Q6PFE7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms