Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SvoplQ6PDF3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms