Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rrp12Q6P5B0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rrp12Q6P5B0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms