Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NipblQ6KCD5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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