Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tpm4Q6IRU2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms