Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Krt40Q6IFX3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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