Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TroQ6DIC6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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TroQ6DIC6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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TroQ6DIC6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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TroQ6DIC6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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TroQ6DIC6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TroQ6DIC6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms