Protein–RNA interactions for Protein: Q68FF7

Slain1, SLAIN motif-containing protein 1, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slain1Q68FF7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slain1Q68FF7 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms