Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg9aQ68FE2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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