Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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PtprdQ64487 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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PtprdQ64487 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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PtprdQ64487 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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PtprdQ64487 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PtprdQ64487 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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