Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Tfe3Q64092 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Tfe3Q64092 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Tfe3Q64092 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Tfe3Q64092 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Tfe3Q64092 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Tfe3Q64092 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tfe3Q64092 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms