Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Ss18Q62280 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Ss18Q62280 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Ss18Q62280 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Ss18Q62280 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Ss18Q62280 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ss18Q62280 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ss18Q62280 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ss18Q62280 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Ss18Q62280 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ss18Q62280 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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