Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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PcolceQ61398 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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PcolceQ61398 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PcolceQ61398 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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PcolceQ61398 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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PcolceQ61398 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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PcolceQ61398 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PcolceQ61398 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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PcolceQ61398 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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