Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

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Length 819 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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Nell2Q61220 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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Nell2Q61220 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Nell2Q61220 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Nell2Q61220 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Nell2Q61220 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Nell2Q61220 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Nell2Q61220 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Nell2Q61220 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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Nell2Q61220 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Nell2Q61220 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nell2Q61220 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms